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数据载入

SCMeTA 可直接从质谱仪的原始文件中加载数据,也可从其他软件载入经过处理的数据、或与 SCMeTA database 连接。

从质谱仪的原始文件中中加载

SCMeTA 现在可以直接从以下格式加载数据:

  • Thermo RAW File
  • Waters wiff File
  • txt file

:::提示 mzML 及其他格式的处理方法仍在开发中,我们欢迎您提供其他类型的海量数据,以帮助我们改进 SCMeTA。 :::

在 Linux/Windows 系统中,SCMeTA 使用 pythonnet 来载入质谱数据。在 macOS 上,SCMeTA 使用 pyRawTools 来载入质谱数据。

python

sc.load("data.RAW")

Load processed data

Once you have processed data from other software, you can load it with SCMeTA.

python
sc.load_processed("data.csv")

Connect with SCMeTA database

python
sc.load_from_db(DATA_ID)