数据载入
SCMeTA
可直接从质谱仪的原始文件中加载数据,也可从其他软件载入经过处理的数据、或与 SCMeTA database 连接。
从质谱仪的原始文件中中加载
SCMeTA 现在可以直接从以下格式加载数据:
- Thermo RAW File
- Waters wiff File
- txt file
:::提示 mzML 及其他格式的处理方法仍在开发中,我们欢迎您提供其他类型的海量数据,以帮助我们改进 SCMeTA。 :::
在 Linux/Windows 系统中,SCMeTA 使用 pythonnet 来载入质谱数据。在 macOS 上,SCMeTA 使用 pyRawTools 来载入质谱数据。
python
sc.load("data.RAW")
Load processed data
Once you have processed data from other software, you can load it with SCMeTA
.
python
sc.load_processed("data.csv")
Connect with SCMeTA database
python
sc.load_from_db(DATA_ID)