安装

:::提示 Windows 系统环境下的 Data Load 数据载入功能仍在开发中，建议使用 Linux 或 macOS 系统进行 SCMeTA 数据处理. :::

以下为 SCMeTA 的安装流程:

Use PyPI

在 PyPI 中使00用以下pip，即可安装SCMeTA。

pip install scmeta

Dependencies for loading data

如要完成对 Thermo RAW data 和 Waters WIFF data 两种数据的载入，需要在 Windows 系统上搭载 .NET Framework ，或在 Linux 和 macOS 系统上搭载 mono . SCMeTA支持以下版本的 .NET Framework and mono 环境：

• .NET Framework 4.7.2
• .NET Framework 4.8
• .NET Framework 4.8.1
• 6.12 或更新版本的 mono.

在 Windows 系统上安装 .NET Framework

详情请见 .NET Framework installation guide

在 macOS / Linux 系统上安装 mono

需要安装 6.12 或更新版本的 mono to load Thermo RAW data. 更多详情请见 mono installation guide.

对于 macOS 系统:

brew install mono

对于 Linux 系统:

更多详情请见 mono installation guide.

关于python

SCMeTA的运行依赖于以下库:

• pandas
• numpy
• scipy
• matplotlib
• sci-kit learn
• umap-learn
• combat
• pyRawTools