SCData

SCData 是一个用于存储和操作 SCMeTA 数据的类。

Data Structure

它包含以下用于存储数据的属性：

• raw: 一个包含 SCMeTA 原始数据的 pandas DataFrame。
• process: 一个 pandas DataFrame，其中包含 SCMeTA 处理过的数据。
• mat: 一个 pandas DataFrame 矩阵，其中包含经过处理的 SCMeTA 数据。
• cell_mat: 一个 pandas DataFrame 矩阵，其中包含经过处理的 SCMeTA 数据，以细胞为行，代谢物为列。
• cell_pos: 一个 pandas DataFrame，其中包含按时间线排列的细胞扫描位置

方法

包含了以下几种处理数据的方法：

load(path) 路径

参数：

• path: str 数据文件夹所在的路径。

data = SCData()
data.load(path)

cut(start, end) 数据截取

参数：

• start: int 截取数据的起始位置；
• end: int 截取数据的结束位置。

data.cut(0, 100)

offset(offset)

参数：

• offset: float 要添加到数据中的偏移量。

data.offset(0.1)

xic(mz)

参数:

• mz: float 提取特征离子流图所用的质荷比.

data.xic(760.58)